质谱仪停电保护的注意事项如下：
1、最好不用直接进样(容易污染离子源)。
2、做联用时最好分流(①可以使用常规柱，②缩短分析时间，③延长质量分析器寿命)。
3、最好使用在线切换阀，降前每个样品的前后1-2分钟的流动相切入废液。
4、开始联用前，直接运行质谱数分钟，可以先将温度。
5、待机时将切换阀置于waste，避免刚开液相时将流动相打入离子源。
6、关机前毛细管的温度先降下来，稳定一段时间后再关闭电源，避免风扇停止转动后毛细管外围的热量向里扩散，容易引起内部线路及电子元器件老化加速。
7、每天清理毛细管口外部，擦洗干净，每次停机时注意清洗Skimmer，用无尘擦拭纸，kimberly那种。
8、如果用的是钢瓶而且天天做样的话，将两个钢瓶并联，当然，一月不做一次的话就算了。
9、做定量时注意离子源喷针的具体位置，否则标准曲线就不能用了。
10、不要不经过柱子分离进行定量分析，结果不可靠(竞争性抑制目标分子离子化)。
11、如果是负离子检测的话，可以相流动相中加入少量异丙醇。
12、不要使用不挥发性盐，如果使用挥发性盐，但浓度不要超过20mmol/l。
13、需要使用酸的情况下可以用甲酸，乙酸可以用，但能用甲酸或乙酸时就别用TFA。
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